Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1978699	1978771	73	47 [0]	[0] 13	motA	proton conductor component of flagella motor

CTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCT  >  W3110S.gb/1978637‑1978698                                                              | cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAGTCGCt  >  1:85263/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:748910/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:449440/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:493943/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:510760/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:546301/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:578530/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:610380/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:610407/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:628969/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:636415/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:654152/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:699527/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:437868/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:752627/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:761324/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:812264/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:859039/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:884832/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:892786/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:893378/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:954518/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:987771/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:997543/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1438067/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1172010/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1219487/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1245097/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1269979/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1271746/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1273051/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1274628/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1362941/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1378920/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:139210/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1167020/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1456226/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1467802/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1591071/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:160846/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:1623454/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:166455/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:168436/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:190827/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:204132/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCt  >  1:296270/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGACTTTAATCGCt  >  1:1328540/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAGCGTGCCTTTAATCGCT  >  W3110S.gb/1978637‑1978698

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑