Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1982406	1982583	178	47 [0]	[0] 7	otsA	trehalose‑6‑phosphate synthase

CGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCT  >  W3110S.gb/1982359‑1982405                                               | cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:652185/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:32212/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:322198/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:402250/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:403348/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:45175/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:503999/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:513621/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:526063/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:549893/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:584369/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:611287/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:291924/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:669739/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:688447/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:716314/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:732740/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:744362/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:747871/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:755460/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:807701/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:864450/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:964866/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:97007/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1443225/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1033870/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1059515/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1102267/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1110649/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1130793/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:123828/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1279414/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1336602/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1363404/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1377412/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1439505/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1014901/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1464201/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1570828/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1576766/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:163751/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1645005/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:1647367/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:166530/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:20095/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:220290/1‑47 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt  >  1:291595/1‑47 (MQ=255)                                               | CGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCT  >  W3110S.gb/1982359‑1982405

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑