Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2020320 2020329 10 65 [0] [0] 20 fliJ flagellar protein

CGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGCC  >  W3110S.gb/2020259‑2020319
                                                            |
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:458608/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:56836/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:559593/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:531152/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:501011/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:479147/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:476347/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:463245/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:45988/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:587506/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:431609/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:424368/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:405856/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:389312/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:372617/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:36741/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:360879/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:34713/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:589100/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:596652/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:59754/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:654206/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:669965/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:700459/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:765457/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:773248/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:826901/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:86436/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:878637/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:879262/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:880922/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:904911/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:940427/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1388362/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:11089/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1124746/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1135861/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1155075/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:115567/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1157345/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1251826/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:126197/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1280391/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1331017/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1339330/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1350367/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:13597/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1362328/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1362384/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1069482/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1397503/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1424343/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1473161/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:149067/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1501808/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1550335/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1577303/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1583511/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:1628344/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:187350/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:234607/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:261576/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:281802/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:291054/1‑61 (MQ=255)
cGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGcc  >  1:337486/1‑61 (MQ=255)
                                                            |
CGGGATAACCAGCAACCGCTGGATCAACTATCAGCAGTTTATCCAGACGCTGGAAAAAGCC  >  W3110S.gb/2020259‑2020319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: