Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2024878	2025343	466	89 [0]	[1] 82	[fliQ]–[fliR]	[fliQ],[fliR]

TGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAC  >  W3110S.gb/2024815‑2024877                                                               | tGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTT‑GTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1030352/62‑1 (MQ=255)  gcgccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:859234/59‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTTGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1077486/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTTTTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:690700/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGTAGGCCGCCAc  <  1:132162/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCTCCAc  <  1:98971/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:420519/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1642788/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:40604/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:394864/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:388212/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:387744/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:383983/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:360435/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:344329/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:316557/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:282008/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:259714/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:254143/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:251573/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:247809/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:215376/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:190925/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1025112/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:712084/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:982471/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:944516/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:944269/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:868559/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:84610/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:803742/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:799645/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:747666/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:733/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:454645/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:661413/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:649543/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:623372/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:586092/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:54682/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:533872/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:527150/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:520276/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1161252/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1281132/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1257087/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1604857/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1236923/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1229337/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:120673/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1199242/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1182294/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1173467/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1250080/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1145554/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1121254/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1114304/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1086882/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1071448/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1042788/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1039377/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1038709/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1002512/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1284815/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1292577/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1313455/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1323182/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1332162/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1603380/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:137442/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1582952/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1382573/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1401252/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:156784/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1532900/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1528381/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1527233/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1424150/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGCATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1155961/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTATTCTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:49873/62‑1 (MQ=255)  gCCCCGCTAGTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:866843/62‑1 (MQ=255)   ccccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1407841/61‑1 (MQ=255)   ccccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:897354/61‑1 (MQ=255)   ccccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1350913/61‑1 (MQ=255)   ccccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:188424/61‑1 (MQ=255)     ccGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACTGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:701715/59‑1 (MQ=255)         tATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:1147404/55‑1 (MQ=255)                  tAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:258894/46‑1 (MQ=255)                          gTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc  <  1:657101/38‑1 (MQ=255)                                                               | TGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAC  >  W3110S.gb/2024815‑2024877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑