Missing coverage evidence...
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ACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAT  >  W3110S.gb/2036042‑2036103                                                              | aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:767238/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:462624/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:524973/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:389862/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:561569/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:30226/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:278364/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1001092/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:574732/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:157678/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:748537/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1488213/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1486426/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1444473/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1441487/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:139981/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1374785/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:827276/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:843118/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1177735/62‑1 (MQ=255) aCATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:942551/62‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1644471/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:761627/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:811492/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:423720/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1598418/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1507312/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1507097/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1504088/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1361173/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1323890/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:128599/61‑1 (MQ=255)  cATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:1075288/61‑1 (MQ=255)   aTTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt  <  1:353870/60‑1 (MQ=255)                                                              | ACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAT  >  W3110S.gb/2036042‑2036103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑