Missing coverage evidence...
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AGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATG  >  W3110S.gb/2048007‑2048068                                                       |        aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:711543/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:49672/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:511433/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:512077/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:527893/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:562188/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:579147/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:612983/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:650910/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:697740/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:4816/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:714349/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:777772/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:861244/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:870115/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:873170/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:898913/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:901957/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:913993/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:942524/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:469499/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1153585/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1173405/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1231541/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1248428/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1297879/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1304563/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1308578/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:131445/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1380745/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1593650/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:186708/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:197667/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:331192/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:348669/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:351162/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:432728/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1144652/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGtattgat  >  1:702589/1‑59 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACCCGCCAGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1157677/1‑55 (MQ=255) aGAAAGCTGGCTACACGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAg         >  1:1400405/1‑55 (MQ=255)                                                       |        AGAAAGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATG  >  W3110S.gb/2048007‑2048068

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑