Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2055973	2056279	307	23 [0]	[3] 23	shiA	shikimate transporter

CGCCGCACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCG  >  W3110S.gb/2055911‑2055972                                                              | cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:388111/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:972778/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:956061/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:754156/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:744041/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:738583/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:713/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:704080/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:526781/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:516199/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:489193/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:459478/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1109742/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:30174/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:214378/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1598839/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1497486/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1449204/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1398923/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1237812/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1224836/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:1128220/1‑62 (MQ=255) cgccgcACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCAGGCGATGGGAACGCTcg  >  1:131085/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGCCGCACTGGTGTTTAATCGCGAGTTTTTCCCGCAAGTAAGCCCGGCGATGGGAACGCTCG  >  W3110S.gb/2055911‑2055972

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑