Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2056341	2056886	546	21 [0]	[0] 48	shiA	shikimate transporter

AGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTATGATG  >  W3110S.gb/2056280‑2056340                                                             | aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:281780/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:898223/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:814961/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:805775/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:740224/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:733801/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:574941/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:365422/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:32871/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1155297/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:24227/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1567650/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1489114/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1461098/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1372383/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1340519/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1284194/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1250267/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:1182337/61‑1 (MQ=255) aGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAATatgatg  <  1:88766/61‑1 (MQ=255)            gtgtAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGGTTCATTGATCAGTatgatg  <  1:388411/50‑1 (MQ=255)                                                             | AGTTGGCTACGGTGTAGGTTTACTGCTTTCAACCGGACTGGTTTCATTGATCAGTATGATG  >  W3110S.gb/2056280‑2056340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑