Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2099682	2099697	16	70 [0]	[0] 114	cld	regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

AGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTG  >  W3110S.gb/2099621‑2099681                                                             | aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCGAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1183867/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:692621/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:716104/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:671514/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:671259/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:547110/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:493855/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:493301/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:492762/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:44667/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:419879/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:350598/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:345547/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:337154/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:32897/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:308881/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:306718/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:254412/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:248932/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:860493/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:950685/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:929696/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:919329/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:91432/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:91185/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:892600/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:88283/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:872981/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:222415/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:855667/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:849221/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:840276/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:807048/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:778887/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:77695/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:717965/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1169266/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1030862/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1444423/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:128902/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1269032/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1267726/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1242561/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1209819/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1206992/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1453613/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1158735/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1142370/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1098229/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1093633/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1053517/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1045936/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1039312/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1462596/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:214060/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1648279/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1628056/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1624331/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1622398/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:160929/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1601867/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1596862/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1595259/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1577904/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1558355/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1549243/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1545947/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1543261/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTg  >  1:1461397/1‑61 (MQ=255) aGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGCCTGATAGTAGTTTg  >  1:1196537/1‑61 (MQ=255)                                                             | AGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCAGGTTTTGACGAGTCTGATAGTAGTTTG  >  W3110S.gb/2099621‑2099681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑