Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2107867 2107880 14 79 [0] [0] 8 wbbI conserved hypothetical protein

CTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGCA  >  W3110S.gb/2107806‑2107866
                                                            |
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:443154/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:587981/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:586510/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:555907/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:498620/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:494019/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:480721/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:480247/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:478654/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:465181/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:602547/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:424171/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:396376/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:384821/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:383518/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:359086/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:350544/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1005343/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:280615/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:758279/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:962170/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:961740/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:945580/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:924706/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:911684/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:798745/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:791110/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:779285/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:297545/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:752561/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:717997/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:700713/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:688768/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:682913/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:641143/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:621764/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:608338/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1274339/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:14896/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:269609/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1466862/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1457840/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1446277/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1444982/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1388105/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1377133/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1373545/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1484506/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1262153/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1239143/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1198444/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1193367/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:115953/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1135757/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1120288/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1099260/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1035019/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1512042/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1495076/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1538112/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1561314/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:222885/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:156997/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1587165/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1595213/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1600958/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:218072/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1644012/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1644166/61‑1 (MQ=255)
cTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:212543/61‑1 (MQ=255)
 tAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:322335/60‑1 (MQ=255)
 tAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:189551/60‑1 (MQ=255)
  aaGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:241622/59‑1 (MQ=255)
  aaGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:832780/59‑1 (MQ=255)
  aaGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1618163/59‑1 (MQ=255)
  aaGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:66276/59‑1 (MQ=255)
     gTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:1514766/56‑1 (MQ=255)
               aTTTGTGGATTGTGACTTATGTCCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:940492/46‑1 (MQ=255)
                      gATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGca  <  1:470819/39‑1 (MQ=255)
                                                            |
CTAAGGTACTTTGTCATTTGTGGATTGTGACTTATGACCATATCACAGGTAGCAAGCCGCA  >  W3110S.gb/2107806‑2107866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: