Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2164224	2164367	144	71 [0]	[0] 23	mdtD	multidrug efflux system protein

ACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGC  >  W3110S.gb/2164163‑2164223                                                             | acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:300404/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:558335/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:557944/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:468381/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:460542/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:384345/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:370685/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:347275/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:317828/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:577994/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:287560/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:275505/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:2699/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:256381/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:224939/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:187876/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1642034/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1628529/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:829685/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:991915/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:974319/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:958232/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:919100/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:912811/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:877347/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:875473/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:869757/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1625947/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:776242/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:773962/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:765155/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:740012/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:6899/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:672452/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:650413/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:630205/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1107224/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1279201/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1275615/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1260064/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1253646/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1175470/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1168614/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1151811/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1147715/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1282386/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1099524/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1094080/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1079888/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1070094/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:106552/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1046748/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1046080/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1302850/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1618540/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1612210/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1608598/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:157809/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1557441/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1532746/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1513749/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1501956/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1472776/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1351793/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1346622/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1345583/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1339536/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1316620/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1315000/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1042269/1‑61 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGACGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGc  >  1:1137894/1‑61 (MQ=255)                                                             | ACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGC  >  W3110S.gb/2164163‑2164223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑