Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2197350	2198254	905	31 [0]	[0] 81	[mrp]–[metG]	[mrp],[metG]

CGCTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTC  >  W3110S.gb/2197289‑2197349                                                             | cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:369365/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:980699/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:972360/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:954580/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:951045/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:946053/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:889540/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:722521/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:697949/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:640163/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:535937/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:518507/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:511482/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:478523/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:460508/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:100605/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:332832/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:266378/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:202270/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:166361/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:164897/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1633959/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1501513/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1433614/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:14165/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1209949/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1144717/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1122855/61‑1 (MQ=255) cgcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1088532/61‑1 (MQ=255)  gcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:638179/60‑1 (MQ=255)  gcTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTc  <  1:1236597/60‑1 (MQ=255)                                                             | CGCTACATTGCTCTTTTAACTCTTCGAACGCGCTATGCCAGACAAACGGCATAACCAGTTC  >  W3110S.gb/2197289‑2197349

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑