Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2229266	2229457	192	44 [0]	[0] 65	yohD	conserved inner membrane protein

GAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCGCATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCTGGT  >  W3110S.gb/2229204‑2229265                                                              | gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTGAAGTTCCCGCtggt  >  1:384721/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:535945/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1005885/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:227149/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:248437/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:30329/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:310710/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:3350/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:401199/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:410593/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:455436/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:186273/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:596216/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:626171/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:672631/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:745945/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:824136/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:830424/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:944637/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:949990/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:97686/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:995461/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1646690/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1010781/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1028055/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1075677/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1075995/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:111471/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1261314/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1264814/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1272530/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1323235/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1383007/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:146657/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1469332/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1556038/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1593489/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1607274/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1623563/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1624132/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1627984/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:177557/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGAACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:430176/1‑62 (MQ=255) gAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGAGTTGCGGCACATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCtggt  >  1:1461874/1‑62 (MQ=255)                                                              | GAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCGCATCAGGGGCTATTAAAGTTCCCGCTGGT  >  W3110S.gb/2229204‑2229265

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑