Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2236304	2236524	221	25 [0]	[0] 90	sanA	hypothetical protein

TCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAC  >  W3110S.gb/2236243‑2236303                                                             | tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCTCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1372167/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1607060/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:959432/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:881348/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:784786/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:6656/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:64254/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:584065/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:347350/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:346272/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:263987/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:207122/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:206383/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1063468/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1580333/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1525358/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1414495/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1364678/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:135214/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1328198/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1190337/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1188320/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1141132/61‑1 (MQ=255) tCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:1128749/61‑1 (MQ=255)  ccTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAc  <  1:415495/60‑1 (MQ=255)                                                             | TCCTGATCGGCTTGCTGCTGTTGACTGTGCTCGGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAAC  >  W3110S.gb/2236243‑2236303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑