Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2304344	2304606	263	85 [0]	[0] 47	napA	nitrate reductase, periplasmic, large subunit

CTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTTTCT  >  W3110S.gb/2304283‑2304343                                                             | ctaaCTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1531818/58‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:615022/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:731053/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:702604/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:691969/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:684906/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:681799/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:669196/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:663591/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:657936/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:636753/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:731724/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:570535/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:559923/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:557426/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:554057/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:543998/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:499611/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:458753/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:38916/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:387194/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:350910/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:883963/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:980450/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:97899/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:978191/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:957507/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:925293/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:90811/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:906458/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:903936/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:891473/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:8894/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:335946/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:869755/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:867703/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:863883/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:819494/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:800581/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:775830/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:761442/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:759312/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:738485/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1226581/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1002104/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1421875/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1421613/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1380799/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1307984/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1304202/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1278458/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:125441/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1253511/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1432276/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1184243/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1184055/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1116383/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1101323/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:109610/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1058331/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1050002/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1046559/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1002248/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1622088/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:334680/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:332417/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:308993/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:284228/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:221505/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:219605/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:214620/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:166646/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:145016/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1578428/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1547893/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1542261/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1515902/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1508516/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1466050/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1461245/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1456231/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1456150/61‑1 (MQ=255) cTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCAAGCAGTTCCGGTttct  <  1:176912/61‑1 (MQ=255)  tCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:766393/60‑1 (MQ=255)  tCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTttct  <  1:1046653/60‑1 (MQ=255)                                                             | CTCACTTCCGGTGTGGCATACAGCACTTCGTACAGCGTTTTGCCACGCAGTTCCGGTTTCT  >  W3110S.gb/2304283‑2304343

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑