Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2316919 2317125 207 36 [5] [1] 69 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

ACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGG  >  W3110S.gb/2316879‑2316925
                                       |       
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:277845/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:987106/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:982242/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:872792/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:857950/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:827431/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:760833/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:737007/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:694407/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:656088/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:63930/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:545511/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:520627/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:473351/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:462937/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:425254/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:103879/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1174482/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1196539/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1215900/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1251461/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1324669/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1341977/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1459032/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1486618/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1491320/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1607673/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:17435/40‑1 (MQ=255)
aCCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:1050040/40‑1 (MQ=255)
  ccGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:63313/38‑1 (MQ=255)
   cGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa         <  1:117487/37‑1 (MQ=255)
       tcttTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATggg  >  1:967225/1‑40 (MQ=255)
       tcttTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATggg  >  1:1330556/1‑40 (MQ=255)
       tcttTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATggg  >  1:174911/1‑40 (MQ=255)
       tcttTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATggg  >  1:1008675/1‑40 (MQ=255)
       tcttTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATggg  >  1:2534/1‑40 (MQ=255)
                                       |       
ACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGG  >  W3110S.gb/2316879‑2316925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: