Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2322195 2323676 1482 34 [0] [0] 12 rcsC hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

ATCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCCAC  >  W3110S.gb/2322145‑2322194
                                                 |
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:57612/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:319502/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:327885/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:371470/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:419353/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:425258/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:437961/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:440487/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:477562/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:289580/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:61274/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:673923/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:722921/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:823325/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:834103/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:918348/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:994437/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1528686/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1062392/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:107867/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1126800/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1338307/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1370565/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1402949/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1449433/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1473104/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1061039/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1567359/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:1618925/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:22589/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:232955/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:233866/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:248905/1‑50 (MQ=255)
aTCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCcac  >  1:281099/1‑50 (MQ=255)
                                                 |
ATCAAATAAATACGCGCCAACAATGCCGGTAGCTCATGCGGAGCAGCCAC  >  W3110S.gb/2322145‑2322194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: