Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2324479	2324726	248	32 [0]	[0] 48	[rcsC]–[atoS]	[rcsC],[atoS]

TAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACT  >  W3110S.gb/2324440‑2324478                                       | tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:378937/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:955197/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:837682/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:82711/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:810439/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:801005/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:770674/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:756641/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:686794/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:670844/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:662499/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:626377/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:56721/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:541655/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:517277/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:419917/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1062291/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:306082/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:29083/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:283762/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1604515/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1601856/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1561078/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1556206/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1554036/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1476016/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1412267/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:132352/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:129359/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:12368/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACt  >  1:1081307/1‑39 (MQ=255) tAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGACAGAGCACt  >  1:1460570/1‑39 (MQ=255)                                       | TAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACT  >  W3110S.gb/2324440‑2324478

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑