Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2369736	2369744	9	42 [0]	[0] 119	ais	conserved hypothetical protein

GTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCAC  >  W3110S.gb/2369674‑2369735                                                              | gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTacac  >  1:829852/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:681538/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:326224/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:399985/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:408747/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:4197/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:453624/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:487746/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:505922/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:514023/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:552211/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:659593/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:314330/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:681946/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:707605/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:726297/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:832226/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:841460/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:942879/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:949167/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:950448/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1550432/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1098169/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1171745/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1193069/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1200349/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:128174/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1398815/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1401978/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1469007/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1509344/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:152347/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1039937/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:156527/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:157942/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:1646539/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:196575/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:201143/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:225102/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:233110/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:237432/1‑62 (MQ=255) gTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCcac  >  1:27149/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTCAGATTGAAAATTTAGTGGTTAACGAATTCCCCATCCAGATAAACTTTGCCTTTTTCCAC  >  W3110S.gb/2369674‑2369735

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑