Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2411124 2412276 1153 109 [0] [0] 49 [lrhA]–insA [lrhA],insB,insA

Only 100 of 109 total aligned reads displayed.

ACGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTTTGTTG  >  W3110S.gb/2411063‑2411123
                                                            |
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1085925/61‑1 (MQ=255)
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:505370/61‑1 (MQ=255)
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:58809/61‑1 (MQ=255)
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:697448/61‑1 (MQ=255)
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1049659/61‑1 (MQ=255)
aCGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1446634/61‑1 (MQ=255)
 cGCAGGGTTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1150343/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:38715/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1578437/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:475844/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:461926/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:450265/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1614003/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1630505/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:44476/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:417579/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:368655/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:581466/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:284314/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:256956/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:205274/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:191934/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:180148/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1631185/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:854944/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:967174/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:961752/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:943528/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:936014/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:922111/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:920777/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:918092/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:866954/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:528804/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:834413/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:802076/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:784537/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:772801/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:761845/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:587921/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:100803/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:559118/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1346069/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1082240/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1077882/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1271599/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:120536/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1191430/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:109789/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:115906/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1051623/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1323470/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1037046/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1326248/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1028925/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1570803/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1362647/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1148437/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1425891/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1440669/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1014429/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1099872/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1110335/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:100695/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTctgttg  <  1:150104/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTCAACAGTttgttg  <  1:1040352/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTAGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:390492/60‑1 (MQ=255)
 cGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGGTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1558708/60‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1074996/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:874002/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1071378/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1156797/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:949568/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:955523/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:798719/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:964942/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1104740/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1132838/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:399748/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1605678/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:16290/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1463093/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:192868/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:231655/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:253104/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:353467/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:390168/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1314807/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1279400/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1268818/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1242097/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:1166783/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:597015/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:619666/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:635243/59‑1 (MQ=255)
  gCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:681318/59‑1 (MQ=255)
   cAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:696812/58‑1 (MQ=255)
                        aagaagTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:13208/37‑1 (MQ=255)
                         agaagTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:695/36‑1 (MQ=255)
                          gaagTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTttgttg  <  1:949844/35‑1 (MQ=255)
                                                            |
ACGCAGGATTTTCCTGGCGTAACCAAGAAGTTGAATGCCATGTTCAGTTAACAGTTTGTTG  >  W3110S.gb/2411063‑2411123

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: