Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2455416	2455451	36	48 [0]	[0] 43	yfcO	hypothetical protein

TCATTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACG  >  W3110S.gb/2455354‑2455415                                                              | tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATGACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1611705/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCAGCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1297617/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:468118/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:296018/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:331726/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:331925/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:34882/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:371970/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:383359/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:398550/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:407997/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:423312/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:440474/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:449474/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:24436/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:474413/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:486990/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:557369/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:593733/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:626607/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:644557/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:665778/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:709691/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:728963/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:784714/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1393921/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1123959/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1137476/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:116062/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1237717/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1269388/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1280619/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1283579/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1303358/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1307154/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1331008/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1340774/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:255622/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1446780/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1511054/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1529470/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1534503/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1538005/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1559188/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1610649/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1618826/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACg  <  1:1038499/62‑1 (MQ=255) tcatTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACAGTAGTAAACg  <  1:234111/62‑1 (MQ=255)                                                              | TCATTATTTTTAAATTAAAAGTCGCAATATTACGCGAATCACCGTTGTAACCGTAGTAAACG  >  W3110S.gb/2455354‑2455415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑