Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2479515	2479532	18	88 [0]	[0] 26	yfdQ	hypothetical protein

ATCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCAAA  >  W3110S.gb/2479454‑2479514                                                             | atCTTAATATAGTGAGGACTTATTTTGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1135199/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCATTTAATCaaa  >  1:1341852/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTTATCaaa  >  1:38053/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:500653/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:615376/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:609332/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:595700/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:581452/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:554749/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:532862/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:529590/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:526262/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:512257/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:511588/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:655480/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:493343/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:464696/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:442806/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:431621/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:42827/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:409270/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:405456/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:399148/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:369884/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:838029/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:970333/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:953618/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:927145/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:919581/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:9179/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:883842/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:883547/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:883501/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:872848/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:859381/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:649701/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:817499/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:815294/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:813291/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:797149/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:771284/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:744871/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:736397/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:693398/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:346145/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1267167/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1360041/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1354578/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1347770/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1347019/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1343721/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1342613/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1328627/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1312537/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1293222/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1292970/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1384111/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1248253/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1245373/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1221810/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1160893/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1156867/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1115578/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1085708/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1073053/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1066832/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1059217/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1596330/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1018865/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:287550/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:277849/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:271612/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:223251/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:183803/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:179441/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1602460/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1602154/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1600833/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:360671/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1562281/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:155931/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1535734/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1522035/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1519624/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:149779/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1454453/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1443474/1‑61 (MQ=255) atCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCaaa  >  1:1428258/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATCTTAATATAGTGAGGACTTATTATGTCTCAGAACTTAGACGCAACCGCAATTAATCAAA  >  W3110S.gb/2479454‑2479514

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑