Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2560946	2561583	638	41 [0]	[0] 7	[yffI]–[eutL]	[yffI],[eutL]

GGTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGCCGAC  >  W3110S.gb/2560885‑2560945                                                             | ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:664334/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1067601/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:472827/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:487221/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:488933/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:489384/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:490937/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:514704/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:571292/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:627783/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:472061/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:694654/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:736268/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:745195/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:745912/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:820798/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:8238/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:88691/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:955374/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1544189/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1091077/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:110933/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:135718/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1395938/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1438403/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1533812/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1566876/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1567157/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1567467/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1601051/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1629401/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:221338/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:286391/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:345261/61‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:378568/61‑1 (MQ=255) ggTGGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:185700/61‑1 (MQ=255)  gTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:411176/60‑1 (MQ=255)  gTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:1465797/60‑1 (MQ=255)  gTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:800595/60‑1 (MQ=255)  gTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:870936/60‑1 (MQ=255)  gTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGccgac  <  1:948697/60‑1 (MQ=255)                                                             | GGTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCATCGTCTGGCCGAC  >  W3110S.gb/2560885‑2560945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑