Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2588237	2588406	170	39 [0]	[0] 106	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

GTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTT  >  W3110S.gb/2588196‑2588236                                         | gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:592241/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:339112/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:351999/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:353533/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:364015/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:417237/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:420849/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:463173/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:520608/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:58447/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:267740/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:673425/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:722593/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:832232/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:854754/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:91438/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:972195/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:977690/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:990798/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:993478/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1257115/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1021606/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1026772/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1029585/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1099282/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1130952/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1191633/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1228718/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1234933/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:125274/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1018448/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1265520/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1507695/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1520188/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1567790/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:1588308/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:174934/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:188693/1‑41 (MQ=255) gTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGtt  >  1:208326/1‑41 (MQ=255)                                         | GTGCAACGAAGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTT  >  W3110S.gb/2588196‑2588236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑