Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2608026	2608027	2	42 [0]	[0] 99	hyfG	hydrogenase 4, subunit

CTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGCC  >  W3110S.gb/2607964‑2608025                                                              | cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:784225/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:466903/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:482171/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:523638/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:526073/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:663578/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:674274/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:674825/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:685222/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:695038/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:784129/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:42345/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:83051/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:832330/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:83980/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:902102/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:912830/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:926553/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:944022/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:986926/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:99565/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1519692/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:102866/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1119051/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1131999/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1145145/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1155642/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:116213/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1269559/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1282916/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:134221/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1359135/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1001806/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1529813/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1637027/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:1648398/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:174485/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:194161/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:212708/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:311508/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:311978/1‑62 (MQ=255) cTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGcc  >  1:378550/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTCGATTCTGCTGGAAGTCGAACGGCTACACAGTCATTTGCTTAACCTTGGCCTCTCCTGCC  >  W3110S.gb/2607964‑2608025

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑