Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2667316	2667484	169	64 [0]	[0] 123	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

GCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAA  >  W3110S.gb/2667254‑2667315                                                              | gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:640063/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:401182/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:407669/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:410356/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:419657/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:434950/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:435977/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:46644/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:468364/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:473175/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:50503/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:54197/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:569991/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:581757/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:618673/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:630195/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:397853/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:659223/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:683582/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:690328/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:707073/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:721807/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:778005/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:780997/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:802574/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:851514/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:87000/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:880030/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:930289/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:970211/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:984940/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:993565/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1387709/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1033269/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1061981/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1083617/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1156093/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1219443/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1237398/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1259010/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1273145/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1273455/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1284525/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1290600/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1334846/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1359795/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1371599/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1376374/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1032101/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1400796/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1419331/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1481848/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1580994/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1592695/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1604083/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1615207/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:1626408/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:185344/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:210021/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:224552/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:249659/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:337324/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:377004/1‑62 (MQ=255) gccgATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTaa  >  1:390735/1‑62 (MQ=255)                                                              | GCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAA  >  W3110S.gb/2667254‑2667315

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑