Missing coverage evidence...
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CCGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGA  >  W3110S.gb/2759680‑2759741                                                              | tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTGAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:139985/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:117212/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:778168/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:756214/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:594497/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:59112/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:535041/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:526611/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:523111/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:494585/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:489803/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:248211/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:226100/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:208178/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:164031/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1627268/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1526637/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1481382/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1406264/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1310589/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1307326/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1636453/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:130561/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1287189/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1226838/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1223034/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1204701/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:11995/61‑1 (MQ=255) tcGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:1017108/61‑1 (MQ=255)  cGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:375805/61‑1 (MQ=255)               aTACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCGGACTTATAGCGa  <  1:821502/48‑1 (MQ=255)                     tctcAATCGTTAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGa  <  1:508830/42‑1 (MQ=255)                                                              | CCGCCAAATGGCAAATACCTTCTCAATCGTAAAAGGGACAACTTTGAGCAGACTTATAGCGA  >  W3110S.gb/2759680‑2759741

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑