Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2780861	2780901	41	88 [0]	[0] 72	ypjA	adhesin‑like autotransporter

CCACCATTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACTT  >  W3110S.gb/2780799‑2780860                                                              | ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCGAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:566149/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTGCTGAGAGCCAGACtt  >  1:806999/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:336152/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:510890/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:492370/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:471482/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:463611/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:446245/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:433102/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:405788/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:403045/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:352258/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:340355/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:559661/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:331287/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:331114/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:329162/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:303488/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:247757/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:245942/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:231542/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1003301/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:205025/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:786509/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:993649/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:97911/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:96504/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:943911/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:902245/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:889121/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:86052/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:847827/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:82662/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:544948/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:752661/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:736898/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:702464/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:684895/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:662334/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:632678/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:61598/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:601139/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:230439/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1269452/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1415098/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1410648/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1409276/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1376196/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1351213/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1345574/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1319438/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1300897/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1290648/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1279569/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1274859/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1431329/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1225439/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1170434/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:115746/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1156022/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1151671/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1148171/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1136339/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1129937/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1089985/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1058410/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1587506/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:199371/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:197524/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:197426/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:166897/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1646061/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1631554/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1597780/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1597535/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1588405/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:200446/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1570564/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1545744/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1543620/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1542088/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1495516/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:147910/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1459208/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:1457072/1‑62 (MQ=255) ccaccaTTTATGGTTCTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:501292/1‑62 (MQ=255) ccaccaCTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:4134/1‑62 (MQ=255) caaccaTTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACtt  >  1:249078/3‑62 (MQ=255)                                                              | CCACCATTTATGGTTGTGTTCGTTGCCAGACTTCCTTGTACTACGTCCTGAGAGCCAGACTT  >  W3110S.gb/2780799‑2780860

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑