Missing coverage evidence...
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ATCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCA  >  W3110S.gb/2817412‑2817471                                                            | aTCTTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1632838/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCTCACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1238048/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:663641/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:373593/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:374302/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:449662/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:491268/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:496625/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:517601/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:60349/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:642787/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:318251/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:676223/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:733506/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:791320/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:840485/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:877430/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:879022/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:879388/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:932486/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1496624/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1133749/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1199900/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1248716/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1289878/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1319440/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1327926/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1380241/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1381850/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:367121/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1504298/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1513104/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1526851/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1532609/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:287876/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:29153/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:312864/60‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCa  <  1:1031113/60‑1 (MQ=255)                                                            | ATCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCA  >  W3110S.gb/2817412‑2817471

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑