Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2821090	2821195	106	36 [0]	[0] 36	recX	regulatory protein for RecA

CAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCG  >  W3110S.gb/2821028‑2821089                                                              | cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAGCAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1153523/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1107429/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:862397/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:802710/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:800733/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:741441/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:739157/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:575237/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:56430/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:543418/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:446408/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:445479/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:42323/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:41645/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:328300/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:276332/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1086767/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1110589/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1619129/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1606587/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1509507/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1239862/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1359739/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1469275/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1459319/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1437702/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1422113/62‑1 (MQ=255) cAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCAGCTGTCATCg  <  1:288501/62‑1 (MQ=255)  aGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:713488/61‑1 (MQ=255)  aGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:670965/61‑1 (MQ=255)  aGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:1482597/61‑1 (MQ=255)  aGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:24495/61‑1 (MQ=255)  aGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:874038/61‑1 (MQ=255)   ggTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:706915/60‑1 (MQ=255)         tAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:302710/54‑1 (MQ=255)                         ggCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCg  <  1:500499/38‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGTCCATAACCTTTGCGGCTACGGCTGGCGATAAAGCGCGCAACAAATCGGCTGTCATCG  >  W3110S.gb/2821028‑2821089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑