Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2824823	2824941	119	60 [0]	[0] 40	srlA	glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIC component of PTS

CCGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATGG  >  W3110S.gb/2824761‑2824822                                                              | ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCGCTCAATGAATgg  <  1:803036/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:604769/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1038130/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:289404/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:372425/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:393344/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:394609/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:409172/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:438244/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:451187/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:472671/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:511087/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:519259/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:519643/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:524125/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:590429/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:242732/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:644654/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:682280/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:713878/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:753346/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:804245/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:806185/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:806226/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:851066/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:888749/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:891715/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:974457/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:980152/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1392086/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:10416/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1150916/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1155446/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1187465/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:121926/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1237198/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1251565/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1275134/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1281645/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1297569/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1347828/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1374241/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1390739/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:213055/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:139969/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1426536/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1432324/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1461203/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1523482/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1527706/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1543299/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1570151/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1611730/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1613101/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1619922/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:206332/62‑1 (MQ=255) ccGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCATCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:684/62‑1 (MQ=255)  cGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1615089/61‑1 (MQ=255)  cGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:1645376/61‑1 (MQ=255)          tACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATgg  <  1:936011/53‑1 (MQ=255)                                                              | CCGGAAAAGTACAAACCCAGCTACTACGCGGCGGCCTCTTATAGCTGCCACTCAATGAATGG  >  W3110S.gb/2824761‑2824822

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑