Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2854362	2854396	35	92 [0]	[0] 24	fhlA	DNA‑binding transcriptional activator

TGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTGGG  >  W3110S.gb/2854300‑2854361                                                              | tGAACTGCGCGGCGATGCCTTCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:922973/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCTGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:81236/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:374807/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:561392/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:556493/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:545118/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:489402/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:48900/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:479582/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:478682/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:472594/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:472273/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:445549/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:399075/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:579779/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:315413/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:311914/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:311831/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:274874/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:267694/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:259604/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:255898/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:221996/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1002165/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:767437/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:97983/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:952781/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:891942/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:887410/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:88017/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:870752/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:856845/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:801613/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:781317/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:777340/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:576326/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:742582/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:711992/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:668825/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:619976/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:616444/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:615401/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:609474/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:581847/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:580266/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:202146/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:110617/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:194978/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:131317/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1260793/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1213283/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1206151/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1162657/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1162447/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1131365/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1124387/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1110137/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1331920/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1102347/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1095940/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1088878/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1087754/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1048135/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1040930/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1026766/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1025783/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1016170/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1008619/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1491976/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:193503/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:180740/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:167197/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:164848/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1629839/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1585070/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1529284/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1525977/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:15030/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1502924/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1337344/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1435281/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1433125/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1426252/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1426186/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1411459/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1405672/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1389506/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1365792/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1350895/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1343111/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGAGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:1149848/1‑62 (MQ=255) tGAACTGCGCGGCGATGCCTGACGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTggg  >  1:970671/1‑62 (MQ=255)                                                              | TGAACTGCGCGGCGATGCCTGCCGGATTGCTGGAAAGCGATCTGTTTGGTCATGAGCGTGGG  >  W3110S.gb/2854300‑2854361

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑