Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2924054	2924265	212	58 [0]	[0] 40	yqcD	conserved hypothetical protein

GACGGTGAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGAAA  >  W3110S.gb/2923993‑2924053                                                             | tctggTGAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:21998/58‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:546908/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:101716/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:268776/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:269090/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:273346/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:296074/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:323107/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:388026/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:463398/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:489631/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:5093/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:517765/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:541914/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:215537/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:562339/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:623658/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:628453/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:639079/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:659252/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:730071/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:797373/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:80521/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:812061/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:815539/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:842609/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:86623/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:922823/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1409767/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1038556/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:10546/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1056938/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1056995/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1098177/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1127981/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1154603/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1231006/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1244934/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1247841/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1381577/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1381645/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1408841/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:199941/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1415047/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1427073/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1447500/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1461002/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1489525/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1512482/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1516987/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:178254/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:193108/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:195338/55‑1 (MQ=255)       gAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATAAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:191783/55‑1 (MQ=255)         aaCATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:540322/53‑1 (MQ=255)           cATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:1066757/51‑1 (MQ=255)                 ttcttATGCAAACCATCAGGAACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:144441/45‑1 (MQ=255)                   cttATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGaaa  <  1:343151/43‑1 (MQ=255)                                                             | GACGGTGAAACATGTCTTCTTATGCAAACCATCAGGCACTTGCGGGCCTGACTCTTGGAAA  >  W3110S.gb/2923993‑2924053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑