Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2955675	2956297	623	76 [0]	[0] 25	ptr	protease III

TATACCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTACCC  >  W3110S.gb/2955617‑2955674                                                          | tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:409237/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:554886/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:548064/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:544536/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:509918/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:473838/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:468538/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:467334/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:446109/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:585233/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:403455/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:353832/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:336640/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:333086/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:330348/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1019832/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:326134/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:320674/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:811278/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:989055/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:951637/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:914365/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:908970/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:891489/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:884699/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:855835/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:825708/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:328493/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:783282/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:767446/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:749074/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:745981/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:715199/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:692508/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:640935/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1295778/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:302967/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1491416/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1443234/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:141559/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:140325/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1399405/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1377559/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1336395/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1303982/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1507336/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1217353/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:118009/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1175804/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1171521/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1166852/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1095507/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1066349/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1028963/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:188177/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:279410/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:268762/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:239891/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:220064/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:20359/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:191667/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:184398/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:173476/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1648776/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1622711/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1556782/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1555025/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1549964/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:1548893/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGAACTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:984168/58‑1 (MQ=255) tataCCAGGACTTCGCCCGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:548943/58‑1 (MQ=255)  ataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:19679/57‑1 (MQ=255)  ataCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:577079/57‑1 (MQ=255)   taCCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:557641/56‑1 (MQ=255)     ccAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:329980/54‑1 (MQ=255)          aCTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTAccc  <  1:393511/49‑1 (MQ=255)                                                          | TATACCAGGACTTCGCCTGCTCAAGCTGATCTTCCGTAGCGGTATAGCTAAAGTACCC  >  W3110S.gb/2955617‑2955674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑