Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2997876	2998197	322	95 [0]	[0] 51	ygeR	Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator

TGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAG  >  W3110S.gb/2997814‑2997875                                                              | tggggcggcAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:615949/59‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTGACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1640341/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAAGGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1259826/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACTAATCTGGAAATGCAg  <  1:1459718/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAGATGCAg  <  1:1082634/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:280544/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:600847/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:591441/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:583115/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:556239/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:513171/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:489039/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:479300/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:422859/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:323823/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:300528/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1002078/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:228028/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:196725/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:183060/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1645362/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1626605/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1618238/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1585899/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1573808/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:757133/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:96968/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:968412/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:938118/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:903727/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:884619/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:882218/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:839351/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:836198/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:786569/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:766448/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:611700/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:708600/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:707188/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:699506/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:691989/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:67867/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:663743/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:661313/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:643153/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:62529/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1204880/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1279492/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:155546/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1271621/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1270953/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1267848/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:126042/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1250127/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:124413/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1224431/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1221036/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1214996/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1273966/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1202360/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1115629/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1112957/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1084393/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1083063/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1057291/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1045255/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1026183/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1003942/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1003679/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1302856/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1538370/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1502763/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1496168/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1487637/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1450575/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1409571/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:139826/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1395695/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1378895/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1292796/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1307143/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1324001/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1328209/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1389935/62‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCAGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:233977/62‑1 (MQ=255)  gAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1161324/61‑1 (MQ=255)  gAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:425110/61‑1 (MQ=255)  gAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:47303/61‑1 (MQ=255)  gAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:494467/61‑1 (MQ=255)         cAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1502199/54‑1 (MQ=255)            gTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1189665/51‑1 (MQ=255)               aCGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1608270/48‑1 (MQ=255)                       gATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1444844/40‑1 (MQ=255)                       gATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:1064508/40‑1 (MQ=255)                        aTCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAg  <  1:942675/39‑1 (MQ=255)                                                              | TGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAG  >  W3110S.gb/2997814‑2997875

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑