Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3009193	3009643	451	73 [0]	[0] 22	hyuA	D‑stereospecific phenylhydantoinase

TTTAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTACG  >  W3110S.gb/3009131‑3009192                                                              | tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:44277/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:57927/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:546087/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:542450/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:527835/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:522808/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:518539/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:499125/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:492838/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:469984/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:582142/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:415941/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:40904/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:403345/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:38069/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:369235/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:319782/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:232300/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:203731/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:810678/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:991724/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:961881/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:960174/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:953189/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:947716/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:920307/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:904162/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:830416/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:172480/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:803370/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:790406/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:786095/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:739892/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:703152/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:690994/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:669301/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:586623/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1172211/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1009458/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1254227/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1252706/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1233825/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1231599/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1231065/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1209623/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1184089/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1256926/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1154548/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:115079/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1131452/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1106014/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1054332/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1049395/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1047668/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1014398/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1491638/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1622483/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1621169/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1615081/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:154811/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1544764/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1540836/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1526210/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1261161/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1471059/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1468045/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1327744/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1322395/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1295167/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1295127/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1289936/62‑1 (MQ=255) tttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1264768/62‑1 (MQ=255)  ttAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTAcg  <  1:1043341/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTTAAACTCTATTTAACCTATCAATACAAACTCAACGATGACGAGGTTTTGCAGGCATTACG  >  W3110S.gb/3009131‑3009192

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑