Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3077737	3077825	89	63 [0]	[0] 80	cmtB	predicted mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS

GAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAA  >  W3110S.gb/3077676‑3077736                                                             | gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:572006/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:180140/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:210414/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:229913/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:245723/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:25491/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:282865/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:340727/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:362626/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:370741/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:380273/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:396245/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:424662/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:494464/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:500027/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:527173/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:174999/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:573267/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:625685/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:677387/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:75010/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:767116/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:799403/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:840336/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:856881/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:858208/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:87623/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:898826/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:935326/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:946176/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:964568/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:977701/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1406240/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1050923/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1063524/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1093601/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1117032/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1189575/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1227991/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1244207/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1256016/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1266481/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1283293/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1296977/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:133445/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1358030/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1382395/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1396584/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1032263/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1435430/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1456946/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1466250/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1467301/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1495138/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1545515/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1545943/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1557543/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1560359/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1598202/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:16142/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:1631429/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:168251/1‑61 (MQ=255) gagagTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa  >  1:174849/1‑61 (MQ=255)                                                             | GAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAA  >  W3110S.gb/3077676‑3077736

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑