Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3103220	3103746	527	48 [0]	[0] 8	mltC	membrane‑bound lytic murein transglycosylase C

TCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAATT  >  W3110S.gb/3103180‑3103219                                        | tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:685857/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:497672/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:508501/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:513670/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:545309/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:559928/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:58330/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:594438/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:598071/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:613126/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:643796/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:665000/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:478734/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:689407/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:70747/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:708395/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:818365/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:828778/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:840386/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:877030/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:884716/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:886867/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:911507/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:946935/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:144536/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1053178/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1064140/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1078681/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1080287/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1268334/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1340752/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1409489/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1431744/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1444682/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:104093/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1487405/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1526595/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1585644/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1587835/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:224010/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:286074/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:291940/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:305539/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:378192/40‑1 (MQ=255) tCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:450703/40‑1 (MQ=255) gcAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1060804/39‑1 (MQ=255)  cAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1469305/39‑1 (MQ=255)   aaaGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAAtt  <  1:1071107/38‑1 (MQ=255)                                        | TCAAAGATACCAACGGTTTTGATATTCTGATGGGGCAATT  >  W3110S.gb/3103180‑3103219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑