Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3115846	3115975	130	44 [0]	[0] 24	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

AAATGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGT  >  W3110S.gb/3115784‑3115845                                                              | aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:549785/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:256726/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:258878/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:290058/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:308799/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:367111/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:421632/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:437927/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:459778/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:529143/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:535623/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:255534/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:595675/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:700200/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:766002/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:887622/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:914328/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:92230/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:944178/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:962672/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:979965/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:996377/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1326522/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1026228/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1043108/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1065714/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1126682/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1130562/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1230326/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1252828/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1264122/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1299071/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1299346/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1008787/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1344639/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:135987/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1389999/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:140461/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1412872/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1438603/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:145670/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:156316/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1616402/1‑62 (MQ=255) aaaTGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGt  >  1:1649005/1‑62 (MQ=255)                                                              | AAATGCTCAACAGAGATGCCCGCAAAATCCGGATGGAAGTCGAACGCAGCGCTGTTTCCTGT  >  W3110S.gb/3115784‑3115845

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑