Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3133509	3133864	356	54 [0]	[0] 13	[pitB]	[pitB]

ACGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGA  >  W3110S.gb/3133447‑3133508                                                              | aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAGAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:897637/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGTAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:298216/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:721478/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1003858/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:352439/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:385467/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:442204/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:444240/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:563045/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:609344/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:620501/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:622429/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:65718/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:674931/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:283980/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:730112/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:737957/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:767595/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:797692/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:79977/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:812369/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:819545/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:83044/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:840281/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:890461/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:954206/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1507343/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1080890/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1093943/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1127310/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1179065/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1216433/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1275222/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1315866/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1345214/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1396675/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1405134/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1428173/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1457190/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:276087/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1516793/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1532702/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:154552/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1614693/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1633205/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1646235/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:172795/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:195612/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:200074/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:212603/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:274819/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGGCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:1097683/62‑1 (MQ=255)  cGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:319941/61‑1 (MQ=255)                            cACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGa  <  1:355040/35‑1 (MQ=255)                                                              | ACGGATTTTATGACCGCGCGTGGTTATCACTAGTCAAAAATGGAAATGCCCGATCGCCAGGA  >  W3110S.gb/3133447‑3133508

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑