Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3188538	3188791	254	41 [0]	[0] 7	yqiH	predicted periplasmic pilin chaperone

CTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAA  >  W3110S.gb/3188476‑3188537                                                              | cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAATATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1430692/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTGATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1054463/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:641203/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:281112/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:31345/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:330184/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:43977/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:520068/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:529092/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:540831/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:626568/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:631334/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:182607/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:657115/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:687813/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:744046/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:807308/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:837908/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:850548/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:905784/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:962317/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:969603/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1309501/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1024028/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1051967/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1102337/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1219678/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1225331/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:123141/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1270346/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:127693/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1291800/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:253001/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1318890/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1338824/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1419383/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:149874/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1617008/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:167030/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:176099/1‑62 (MQ=255) cTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTaa  >  1:1003437/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTAACCACCGGAACGGCTATTTTACCGTGTATTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAA  >  W3110S.gb/3188476‑3188537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑