Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3190091	3190564	474	40 [0]	[1] 22	[yqiI]–[glgS]	[yqiI],[glgS]

GTGAGACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTAA  >  W3110S.gb/3190030‑3190090                                                             | gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:695958/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:330898/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:375955/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:396138/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:416047/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:438718/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:459913/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:505773/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:51895/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:59912/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:23951/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:722855/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:76398/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:783267/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:79897/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:807200/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:913622/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:953508/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:958135/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:982777/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1232127/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1060233/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1079901/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1087379/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1094803/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1095323/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1182956/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1200076/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1218638/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1228802/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:105570/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1250906/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1368793/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1379950/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1502218/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1530823/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1534898/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1575291/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1586999/1‑61 (MQ=255) gtgagACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTaa  >  1:1591348/1‑61 (MQ=255)                                                             | GTGAGACGTTTAGCGTAGTCATGACCAAAGATCCGGGTGCGGCCTGTACTGAGCAGTTTAA  >  W3110S.gb/3190030‑3190090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑