Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3195805	3196398	594	44 [0]	[0] 24	glnE	fused deadenylyltransferase and adenylyltransferase for glutamine synthetase

CATCAGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAGCGCG  >  W3110S.gb/3195753‑3195804                                                    | catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGGGATGAgcgcg  >  1:1597992/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:622595/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:394004/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:447982/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:450028/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:466187/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:479171/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:497889/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:515372/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:518632/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:5298/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:608555/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:365862/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:668378/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:686491/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:70200/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:743177/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:778267/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:780199/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:823150/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:825180/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:945354/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:979033/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:303924/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1188560/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1217152/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1240093/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1313839/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1381955/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1411978/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1477769/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1514920/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1542705/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1547700/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1576186/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1618408/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:165740/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:177821/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:260273/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:265702/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:292239/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1029549/1‑52 (MQ=255) catcaGCTTTGATATCAAAGCGATCGAGATGTATATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:1384398/1‑52 (MQ=38) catcaGCTTTGATATCAAAGAGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAgcgcg  >  1:116238/1‑52 (MQ=255)                                                    | CATCAGCTTTGATATCAAAGCGATCGCGATGTTTATTGCCGAGATGAGCGCG  >  W3110S.gb/3195753‑3195804

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑