Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3227817	3227888	72	54 [0]	[0] 85	ygjK	predicted glycosyl hydrolase

CCCGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCTT  >  W3110S.gb/3227889‑3227950 |                                                              cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGAt                            >  1:1282845/1‑36 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGaa                >  1:572111/1‑48 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATg             >  1:902169/1‑51 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGa            >  1:318650/1‑52 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGCCTCTGCGCtt  >  1:1428516/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTgcgc    >  1:1141859/1‑60 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:392668/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:652751/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:615933/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:615404/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:521906/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:508486/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:482096/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:478008/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:424466/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:679897/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:38494/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:361111/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:347135/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:321036/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:228471/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:203455/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:182619/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:801319/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:966119/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:920954/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:901757/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:89455/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:887417/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:85318/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:826604/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:82250/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:807645/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:659667/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:750824/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:734948/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:731873/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:727607/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:718754/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:713691/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:68640/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:102134/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1238626/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1342200/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1318002/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1305799/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:129975/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1290737/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1288036/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:127047/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1262557/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:125505/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1651842/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1156073/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1148890/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1129349/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1128432/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1084698/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1081669/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1068443/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1041793/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1008526/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1500969/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1577066/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1557634/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1534965/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1647204/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:168575/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1522845/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1492400/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1357068/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1470420/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1456502/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1451839/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1393058/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1373099/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:974259/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:1645174/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:1076796/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:278273/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:32059/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:1206217/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCt   >  1:446745/1‑61 (MQ=255) cccGGTGCGCTGGCGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1568226/1‑62 (MQ=255) cccGGTGCCCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCtt  >  1:1169729/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCCGGTGCGCTGGTGCAAAAACTGACAGCAAAAGATGTGCAAGTCGAAATGACTCTGCGCTT  >  W3110S.gb/3227889‑3227950

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑