Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3368240	3368395	156	49 [0]	[0] 75	yhcG	conserved hypothetical protein

CTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTA  >  W3110S.gb/3368396‑3368458 |                                                               cTGATGGATTTCATGCTTGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:900302/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCttt                       >  1:1471286/1‑42 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:341433/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:467633/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:459303/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:431206/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:420097/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:369002/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:363351/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:356861/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:353066/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:504756/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:330388/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:265394/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:224113/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:196763/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:175783/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1015827/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1616099/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:735814/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:991873/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:98684/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:91570/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:908597/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:889653/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:875766/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:795982/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:788400/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:163149/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:723854/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:699855/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:684153/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:608949/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:608922/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:608692/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:506968/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1321925/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1030044/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1032779/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1041236/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1105588/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1109886/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1114573/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1115982/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1163001/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1182424/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1188750/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1226782/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1260080/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:129104/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1329468/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1358454/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1493104/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1577304/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1568754/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1545065/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1532478/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1494901/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1362354/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1462668/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1461006/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1459308/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1449036/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1371212/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:693557/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:1169892/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:377930/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:1081404/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:1054676/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:1407876/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGt    >  1:16805/1‑61 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGATgg                  >  1:864212/1‑47 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGACTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:925442/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAACTT‑GGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTa  >  1:1527807/1‑62 (MQ=255) cTGATGGATTTCATGCTGGAAATTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGtt   >  1:1604952/1‑62 (MQ=255) |                                                               CTGATGGATTTCATGCTGGAACTTGGGGATGATTTTGCCTTTGTTGGTCGGCAGCGAAGGTTA  >  W3110S.gb/3368396‑3368458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑