Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3401512	3401652	141	7 [0]	[0] 64	yhdA	conserved inner membrane protein

CGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATCG  >  W3110S.gb/3401653‑3401691 |                                       cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:584620/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:398907/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:40683/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:422344/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:444155/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:455701/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:459903/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:485963/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:489698/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:498631/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:502071/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:504478/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:546818/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:578782/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:580775/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:582961/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:39174/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:635695/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:638885/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:779737/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:822774/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:885457/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:899547/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:904225/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:918126/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:947366/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:950947/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:954608/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:958242/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:976290/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:980842/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:996686/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1430609/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1048132/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1055812/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1089513/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1143937/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1175997/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1190813/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1197382/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1202715/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1218436/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1257063/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1280163/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1307200/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1343203/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1375058/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1384541/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1013840/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1445301/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:145623/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1465429/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1498055/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1511128/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1566919/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1572666/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1625856/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:1644531/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:177752/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:206117/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:24545/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:335007/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:343824/39‑1 (MQ=255) cGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATcg  <  1:37130/39‑1 (MQ=255) |                                       CGTTTTCGTTGTGATTTTTCACATTGCATTAACGTATCG  >  W3110S.gb/3401653‑3401691

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑