Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3435461	3435879	419	67 [0]	[0] 42	yjaH	conserved hypothetical protein

GTCGTGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCT  >  W3110S.gb/3435880‑3435941 |                                                              gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCTCGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1623278/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCa                     >  1:925949/1‑43 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:227562/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:813069/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:178637/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:124504/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:109435/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATcgccgc   >  1:1188471/1‑61 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:314413/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:253037/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:324753/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:330436/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:390524/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:468072/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:490265/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:492852/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:530638/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:582476/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:629131/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:650994/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:669598/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:718297/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:726690/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:863894/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1039822/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:159719/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1327041/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1373872/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1395297/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1479013/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:148205/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1509772/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1514765/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1589579/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:253812/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1631610/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:164283/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1651729/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1185771/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:199013/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:1027977/1‑62 (MQ=255) gtcgtGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCt  >  1:24191/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTCGTGGTATCGCCACTGCGCCACGGGCTAAACACGGCAAGCAGATGCACATTATCGCCGCT  >  W3110S.gb/3435880‑3435941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑