Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3454998	3455098	101	24 [0]	[0] 66	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

GTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCGG  >  W3110S.gb/3455099‑3455159 |                                                             gTGCCTTCCGGCTCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1529741/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGGTCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1352374/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGTGCAGCGGTGCgg  <  1:1273068/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:306234/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:5603/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:548270/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:546041/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:536919/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:517135/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:392179/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:325548/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:6464/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:267396/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:246950/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:238485/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:236532/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:218894/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:216489/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:193852/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:595395/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1629646/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:647959/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:667723/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:742258/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:755993/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:783954/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:789775/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:816624/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:820011/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:841651/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:895904/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:941262/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:964585/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:983025/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:984150/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1401505/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1018549/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:111693/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:111705/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1126246/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1144300/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1151046/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1161855/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1186095/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1197331/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1205325/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1221078/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:124897/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1312498/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1342210/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1383734/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:187144/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1401541/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:141714/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1420442/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1475246/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1492557/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1502113/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1516981/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1527071/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1587374/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1588565/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1606148/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1626245/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:1626966/61‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCgg  <  1:10055/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACCAGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCGG  >  W3110S.gb/3455099‑3455159

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑