Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3460978	3461216	239	33 [0]	[0] 52	[glyT]–tyrU	[glyT],tyrU

ATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTG  >  W3110S.gb/3461217‑3461269 |                                                     aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCa      >  1:468770/1‑49 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGtt   >  1:1508666/1‑52 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGt    >  1:431761/1‑51 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:688663/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:423469/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:447557/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:476750/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:53132/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:560411/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:609240/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:629338/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:635149/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:658084/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:682441/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:325463/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:697271/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:699406/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:743383/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:74870/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:776782/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:778673/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:8377/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:873010/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:933942/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:95639/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:960861/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:96985/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1383654/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1075302/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1111270/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1120868/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1131430/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1149273/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:115434/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1189421/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1272965/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1313624/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1315007/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:134633/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1347695/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1018892/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1472910/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1490949/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1525005/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1555082/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1602819/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:162837/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:1643086/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:180756/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:200302/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:235347/1‑53 (MQ=255) aTGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTg  >  1:320246/1‑53 (MQ=255) |                                                     ATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTG  >  W3110S.gb/3461217‑3461269

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑