Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3474600	3474616	17	11 [0]	[0] 40	yijD	conserved inner membrane protein

GAGTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGT  >  W3110S.gb/3474617‑3474678 |                                                              gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCTCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1305087/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:600574/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:356396/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:359054/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:403544/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:414199/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:416019/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:500591/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:501318/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:515994/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:573176/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:587300/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:262570/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:710697/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:741021/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:782748/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:783872/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:890297/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:905740/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:951507/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:997204/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1567350/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:103223/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1164747/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1194000/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1228089/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1229696/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1244777/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1375642/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1437411/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1439615/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1023205/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:1615213/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:16245/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:164070/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:169618/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:17634/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:206288/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:239698/62‑1 (MQ=255) gagTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCAGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGt  <  1:24262/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAGTACTGCCGGGAAGAAGTTAGAGCCGATATCCGGATATTCCGCACGAACTACCGTGCTGT  >  W3110S.gb/3474617‑3474678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑